Produkty

Nealkoholické stukovatenie pečene (NAFLD) má široké spektrum chorobných stavov od miernej steatózy charakterizovanej abnormálnou retenciou lipidov v pečeňových bunkách až po steatohepatitídu (NASH), ktorá vykazuje akumuláciu tuku, zápal, nafukovanie a degradáciu hepatocytov a fibrózu.V konečnom dôsledku môže steatohepatitída vyústiť do cirhózy pečene a hepatocelulárneho karcinómu. V tejto štúdii sme analyzovali tri rôzne kmene myší, A/J, C57BL/6J a PWD/PhJ, ktoré vykazujú rôzne stupne steatohepatitídy pri podaní 3,5-dietoxykarbonylu. Diéta obsahujúca -1,4-dihydrokolidín (DDC).Analýza génovej expresie RNA-Seq, analýza proteínov a metabolické profilovanie sa použili na identifikáciu rozdielne exprimovaných génov/proteínov a narušených hladín metabolitov vzoriek pečene myší po liečbe DDC.Analýza dráhy odhalila zmenu metabolizmu kyseliny arachidónovej (AA) a S-adenosylmetionínu (SAMe) na iných dráhach.Na pochopenie metabolických zmien metabolizmu kyseliny arachidónovej vo svetle profilov expresie ochorenia bol vyvinutý a optimalizovaný kinetický model tejto dráhy podľa hladín metabolitov.Následne bol model použitý na štúdium in silico účinkov potenciálnych liekových cieľov pre steatohepatitídu. Pomocou kombinácie experimentálneho a in silico prístupu sme identifikovali metabolizmus AA/eikozanoidov ako vysoko narušený u myší indukovaných DDC.Naša analýza metabolickej dráhy AA / eikozanoid naznačuje, že kyselina 5-hydroxyeikozatetraénová (5-HETE), kyselina 15-hydroxyeikozatetraénová (15-HETE) a prostaglandín D2 (PGD2) sú u DDC myší narušené.Ďalej demonštrujeme, že dynamický model možno použiť na kvalitatívnu predikciu metabolických zmien na základe transkriptomických údajov v kontexte choroby.Okrem toho sa zistilo, že metabolizmus SAMe je narušený v dôsledku liečby DDC.Niekoľko génov, ako aj niektoré metabolity tohto modulu vykazujú rozdiely medzi A/J a C57BL/6J na jednej strane a PWD/PhJ na strane druhej.